Дисперсионный анализ
Сущность дисперсионного анализа состоит в установлении роли отдельных факторов в изменчивости признаков.
Известно, что многие признаки и свойства живых организмов находятся под влиянием наследственности и условий среды. Так, устойчивость животных к болезням зависит от наследственности матери и отца, возраста, пола, уровня кормления и содержания. Это приводит к возникновению огромной изменчивости признаков. С помощью дисперсионного анализа можно установить достоверность и силу влияния, а также относительную роль одного или нескольких факторов в общей изменчивости признака.
Общая изменчивость признака, выраженная общей вариансой с} может быть разложена на изменчивость, зависящую от изучаемых факторов (oi, a$), и изменчивость, обусловленную неучтенными (случайными) факторами (а$)- Если учитывается один фактор А, то общая варианса а$ = а$ + <&■ Если учитываются два фактора — А и В, то общая варианса может быть разложена на компоненты: aj = а\ + a$ + afa + ъ\-
В зависимости от числа учитываемых факторов дисперсионный анализ может быть однофакторным, двухфакторным и т. д. Обычно каждый изучаемый фактор представлен в виде нескольких групп (классов), называемых градациями. Если изучается влияние породы (фактор А) на устойчивость животных к болезни, то градациями будут отдельные породы. Изменчивость внутри каждой градации носит случайный характер (зависит от неучтенных факторов), а между градациями (факториальная) обусловлена влиянием учтенных факторов. Дисперсионный комплекс может быть равномерным (в градациях одинаковое число вариант) инеравномерным(в градациях разное число вариант).
Использование однофакторного дисперсионного анализа при одинаковой численности вариант в группах рассмотрим на следующем примере. Для выявления устойчивости животных в возрасте 31 мес искусственно заражали одинаковым количеством личинок Boophilus microplus и через 20 дней подсчитывали число самок клещей. Результаты эксперимента были следующими:
Градацию | Порода | Число | клещей | на одном | животном | |
А\ | Африкандер х герефорд | 20 | 40 | 70 | 120 | 260 |
Аг | Шортгорн | 50 | 170 | 210 | 450 | 610 |
Аз | Герефорд | 100 | 400 | 570 | 840 | 1200 |
Нужно определить, влияет ли порода на устойчивость скота к клещам. Дисперсионный анализ обычно проводят при наличии различий между средними арифметическими. На одном животном у гибридов африкандер х герефорд в среднем было 102 клеща, у шорггорнов — 398 и у герефордов — 622 (табл. 22). Для упрощения расчетов каждую варианту разделили на 100, поэтому при вычислении х проводили умножение на 100. После всех вычислений заполняем свободную таблицу дисперсионного анализа.
Заключительным этапом дисперсионного анализа является сравнение среднего квадрата а%, характеризующего межгрупповую изменчивость, т. е. влияние изучаемого фактора (породы), и среднего квадрата ai характеризующего внутри-групповую изменчивость, т. е. влияние случайных отклонений. Вычисляем критерий F, который равен 4,36 (табл. 23). Сравниваем фактически полученное значение F с табличным критерием Фишера (табл. 24), который находится с учетом числа степеней свободы vi = 2hv2 = 12 (пересечение вертикальной vi и горизонтальной V2 строк). Табличное значение F = 3,9—6,9. Следовательно, полученная величина F = 4,36 больше табличного значения F = 3,9 при р = 0,95.
Число степеней |
|
| Число | степеней | свободы | (VI) |
|
| |
СВОбОДЫ (V2) |
| 2 | 3 | 4 |
| 5 | | 10 | 20 | 30 |
3 | 34,1 | 30,8 | 29,5 | 28,7 | 28,2 | 27,2 | 26,7 | 26,5 | |
| 10,1 | 9,6 | 9,3 | 9,1 | 9,0 | 8,8 | 8,7 | 8,6 | |
4 | 21,2 | 18,8 | 16,7 | 16,0 | 15,5 | 14,7 | 14,0 | 13,8 | |
| 7,7 | 6,9 | 6,6 | 6,4 | 6,3 | 6,0 | 5,8 | 5,7 | |
5 | 16,3 | 13,3 | 12,1 | 11,4 | 11,0 | 10,1 | 9,5 | 9,3 | |
| 6,6 | 5,8 | 5,4 | 5,2 | 5,1 | 4,7 | 4,6 | 4,5 | |
6 | 13,3 | 10,9 | 9,8 | 9,2 | 8,8 | 7,9 | 7,4 | 7,2 | |
| 6,0 | 5,1 | 4,8 | 4,5 | 4,4 | 4Д | 3,9 | 3,8 | |
7 | 12,3 | 9,6 | 8,5 | 7,9 | 7,5 | 6,6 | 6,2 | 6,0 | |
| 5,6 | 4,7 | 4,4 | 4,1 | 4,0 | 3,6 | 3,4 | з,з | |
8 | 11,3 | 8,7 | 7,6 | 7,0 | 6,6 | 5,8 | 5,4 | 5,2 | |
| 5,3 | 4,6 | 4,1 | 3,8 | 3,7 | 3,3 | 3,2 | ЗД | |
9 | 10,6 | 8,0 | 7,0 | 6,4 | 6,1 | 5,3 | 4,8 | 4,6 | |
| 5,1 | 4,8 | 3,6 | 3,6 | 3,5 | 3,1 | 2,9 | 2,8 | |
10 | 10,0 | 7,9 | 6,6 | 6,0 | 5,6 | 4,9 | 4,4 | 4,3 | |
| 5,0 | 4Д | 3,7 | 3,5 | з,з | з,о | 2,7 | 2,7 | |
12 | 9,3 | 6,9 | 6,0 | 5,4 | 5,1 | 4,3 | 3,9 | 3,7 | |
| 4,8 | 3,9 | 3,5 | 3,3 | 3,1 | 2,8 | 2,5 | 2,5 | |
20 | 8,1 | 5,8 | 4,9 | 4,4 | 4,1 | 3,4 | 2,9 | 2,8 | |
| 4,3 | 3,5 | 3,1 | 2,9 | 2,7 | 2,3 | 2,1 | 2,0 | |
30 | 7,6 | 5,4 | 4,5 | 4,0 | 3,7 | 3,0 | 2,5 | 2,4 | |
| 4,2 | 3,3 | 2,9 | 2,7 | 2,5 | 2,2 | 1,9 | 1,8 | |
50 | 7,2 | 5,1 | 4,2 | 3,7 | 3,4 | 2,7 | 2,3 | 2Д | |
| 4,0 | 3,2 | 2,8 | 2,6 | 2,4 | 2,0 | 1,8 | 1,7 | |
100 | 6,9 | 4,8 | 4,0 | 3,5 | 3,2 | 2,5 | 2,1 | 1,9 | |
| 3,9 | 3,1 | 2,7 | 2,5 | 2,3 | 1,9 | 1,7 | 1,6 | |
200-300 | 6,8 | 4,7 | 3,9 | 3,4 | 3,2 | 2,4 | 2,0 | 1,8 | |
| 3,9 | 3,0 | 2,6 | 2,4 |
| 2,3 | 1,9 | 1,6 | 1,5 |
Вывод. Породная принадлежность животных влияет на их устойчивость к клещам.
Критерий F указывает на влияние изучаемого фактора (если /факт £ Дабл) в общей изменчивости признака. Однако в этом случае он не указывает, между какими х разность достоверна, а между какими — недостоверна.
Показатель силы влияния rw. Когда доказано влияние фактора породы, можно определить и силу этого влияния:
Если в градациях разное число вариант, то по определяется по формуле
Это означает, что влияние породы на варьирование устойчивости животных к клещам составляет 40,2 %, а 59,8 % определяется другими факторами.
Дисперсионный анализ качественных признаков. Например, нужно определить влияние быков-производителей на резистент-ность дочерей к бруцеллезу. Заболеваемость дочерей трех быков была 13,8; 27,7 и 47,6 %. Составляют статистический комплекс (табл. 25), а потом данные заносят в сводную таблицу 26. Вычисляют F, находят табличные значения F (см. табл. 26), которые при vi = а—\ = 3—1 = 2 и V2 = N— а = 263—3 = 260 равны 3,0—4,7. Полученная величина F = 12,6 больше табличной F = 4,7 при р = 0,99.
Вывод. Быки-производители влияют на резистентность дочерей к бруцеллезу.
Чтобы определить показатель силы влияния (rw), вычисляют по:
Таким образом, различия в устойчивости дочерей к бруцеллезу на 11,7 % зависят от генотипа их отцов и на 88,3 %—от других причин.
Контрольные вопросы. 1. Какие вы знаете виды изменчивости? 2. Что такое биометрия? 3. Какие статистические показатели характеризуют совокупность? 4. Какие показатели характеризуют изменчивость? 5. Как можно оценить взаимосвязь между признаками? 6. Как оценить достоверность разности между средними арифметическими двух выборочных совокупностей? 7. Для чего используется дисперсионный анализ?
- Лекция-1
- Глава 1 предмет, методы и значение генетики
- Лекция-2
- Цитологические
- Основы наследственности.
- План: Роль ядра и цитоплазмы в наследственности
- Роль ядра и цитоплазмы в наследственности
- Морфологическое строение хромосом
- Лекция-3 кариотип и его видовые особенности
- 1. Диплоидные наборы хромосом у сельскохозяйственных и некоторых видов домашних, прирученных и лабораторных животных
- Гаметогенез и мейоз
- Лекция-4 закономерности наследования признаков при половом размножении
- Особенности гибридологического метода менделя
- Закон единообразия гибридов первого поколения
- Закон расщепления
- Лекция-5 аллели. Множественный аллелизм
- Анализирующее скрещивание. Правило чистоты гамет
- Отклонения от ожидаемого расщепления, связанные с характером доминирования признака и летальными генами
- Лекция-6 закон независимого наследования признаков.
- 2. Вывод формулы расщепления по генотипу при дигибридном
- Полигибридное скрещивание
- 3. Количество фенотипов и генотипов в f2 при скрещивании родителей,
- Лекция-7 хромосомная теория наследственности
- Полное сцепление
- Неполное сцепление
- Лекция-8 соматический (митотический) кроссинговер.
- Карты хромосом
- Лекция-9 генетика пола.
- 5. Зависимость пола дрозофилы от отношения числа х-хромосом к числу наборов аутосом (Бриджес, 1932)
- 6. Нарушения в системе половых хромосом и их фенотипическое проявление
- Наследование признаков, ограниченных полом
- Проблема регуляции пола
- Лекция-11 молекулярные основы наследственности.
- Доказательства роли днк в наследственности
- Биологическая роль нуклеиновых кислот
- Химический состав и структура нуклеиновых кислот.
- Генетический код
- Лекция-13 генетика микроорганизмов.
- Строение и размножение бактерий
- Строение и размножение вирусов
- Взаимодействие фага с бактериальной клеткой
- Понятие о генотипе и фенотипе микроорганизмов
- Конъюгация
- Трансдукция
- Трансформация
- Лекция-14
- Генная инженерия
- Клеточная инженерия
- Гибридомная технология получения моноклональных антител
- Лекция-15 эмбриогенетическая инженерия.
- Клонирование эмбрионов млекопитающих
- Химерные животные
- Трансгенные животные
- Лекция-30
- Изменчивость и методы ее изучения
- Виды изменчивости
- Методы изучения изменчивости
- Вариационный ряд и его построение
- 9. Распределение сухостойных хорош черно-пестрой породы
- Статистические показатели для характеристики совокупности
- 10. Определение основных статистических величин способом
- Вычисление статистических показателей для малых выборок
- 12. Статистические показатели суммарного эффекта фагоцитоза
- Оценка достоверности разности между средними арифметическими двух выборочных совокупностей
- Типы распределения
- Пуассона
- Критерий хи-квадрат (х2)
- 16. Соответствие фактического распределения семейств теоретически ожидаемому (биномиальному)
- 18. Стандартные значения критерия %
- Изучение связи между признаками
- 20. Определение г для малых выборок
- Дисперсионный анализ
- Лекция-16 мутационная изменчивость.
- Классификация мутаций
- Хромосомные мутации
- Механизм образования числовых и структурных аномалий кариотипа
- Генные мутации
- Лекция-17 индуцированный мутагенез.
- Генетические последствия загрязнения окружающей среды и защита животных от мутагенов
- Антимутагены
- Лекция-18
- Раскрытие сложной структуры гена
- Влияние генов на развитие признаков
- Дифференциальная активность генов на разных этапах онтогенеза
- Взаимодействие ядра и цитоплазмы в развитии
- Регуляция синтеза иРнк и белка
- Влияние среды на развитие признаков
- Генетика популяций
- Популяция и «чистая линия»
- Структура свободно размножающейся популяции. Закон харди - вайнберга
- Основные факторы генетической эволюции в популяциях
- Влияние инбридинга на выщепление рецессивных летальных и полулетальных генов
- 31. Формы уродств в потомстве быка Бурхана 6083
- Генетический груз в популяциях животных
- Генетическая адаптация и генетический гомеостаз популяций
- Генетические основы гетерозиса
- Лекция-20
- Глава 13 группы крови и биохимический полиморфизм
- 32. Системы генетических групп крови
- Наследование групп крови
- 33. Уточнение отцовства по группам крови
- Биохимический полиморфизм
- 34. Некоторые биохимические полиморфные системы
- Лекция-18
- Генетические основы иммунитета
- Структура иммуноглобулинов
- Генетика иммуноглобулинов
- Лекция-19 генетический контроль иммунного ответа
- Главный комплекс гистосовмести мости (мнс)
- Связь мне и других антигенов гистосовместимости с болезнями
- 38. Взаимосвязь аллелей комплекса в с заболеваемостью кур md, % (по Hansen и др.)
- Первичные (врожденные) дефекты иммунной системы
- Лекция-24
- Генетические аномалии у сельскохозяйственных животных
- Генетические аномалии
- Наследственно-средовые аномалии
- Генетический анализ в изучении этиологии врожденных аномалий
- Простой аутосомный рецессивный тип наследования
- Лекция-25 аутосомный доминантный тип наследования
- Сцепленный с х-хромосомой тип наследования
- 42. Сцепленный с х-хромосомой тип наследования
- Мультифакториальное наследование
- Аномалии у сельскохозяйственных животных, обусловленные мутациями генов
- 43. Список генетически обусловленных аномалий у крупного рогатого скота
- 46. Список генетически обусловленных аномалий у овец
- 47. Наследственные дефекты, встречающиеся
- Распространение аномалий хромосом в популяциях животных
- Числовые и структурные мутации кариотипа и фенотипические аномалии животных
- 48. Типы центрических слияний (транслокаций)
- 50. Продолжительность сервис-периода
- 52. Срввнение снижения воспроизводительной способности
- 54. Хромосомные аберрации в разных линиях кур (по Блому, 1974)
- Лекция-26
- Глава 16 болезни с наследственной предрасположенностью
- Генетическая устойчивость и восприимчивость к бактериальным болезням
- Генетическая устойчивость и восприимчивость к гельминтозам
- Генетическая устойчивость и восприимчивость к протозоозам
- Генетическая устойчивость и восприимчивость к клещам
- Генетическая обусловленность респираторных болезней
- Лекция-27 генетическая обусловленность болезней желудочно-кишечного тракта
- Болезни обмена веществ
- Роль наследственности в предрасположенности животных к болезням конечностей
- 74. Чвстотв болезней и деформация копыт у коров различного происхождения, % (по Косолвпикову)
- Роль наследственности в предрасположенности к бесплодию
- Роль наследственности в предрасположенности к стрессу
- Влияние факторов среды на устойчивость к болезням
- Лекция-28
- Учет врожденных аномалий и болезней. Методы генетического анализа
- Повышение наследственной устойчивости животных к болезням
- Оценка генофонда пород
- Наследуемость и повторяемость устойчивости к заболеваниям
- 80. Коэффициент наследуемости устойчивости (%) к некоторым болезням
- Массовый отбор на резистентность
- Комплексная оценка генофонда семейств, линий и потомства производителей
- Лекция-29 показатели отбора при селекции на устойчивость к болезням
- Селекция животных на устойчивость к болезням
- Непрямая селекция на резистентность
- Импульсно-циклический способ разведения по линиям
- Мероприятия по повышению устойчивости к болезням
- Словарь терминов
- Глава 2. Цитологические осоты наследственности. А. И. Жмгачев 9
- Глава 4. Хромосомная теория наследственности. Г. А. Назарова 51
- Глава 6. Молекулярные основы наследственности. Г. А. Назарова .... 74
- Глава 7. Генетика микроорганизмов. Г. А. Назарова 91
- Глава 8. Биотехнология. Г. А. Назарова, в. Л. Петухов 103
- Глава 11. Генетические основы онтогенеза. Г. А. Назарова 178
- Глава 12. Генетика популяций. А. И. Жнгачев 196
- Глава 14. Генетические основы иммунитета. В. Л. Лопухов 228