Ферменты – строение: свойства, механизм действия

Содержание

• Лекции по курсу биохимия и молекулярная биология для студентов направления биология
• Оглавление
• Введение
• Модуль 1. Статическая биохимия
• Лекция 1
• Строение, свойства, биологическая роль
• Моно – и олигосахаридов
• Классификация углеводов
• Моносахариды
• Стереоизомерия моносахаридов
• Представители моносахаридов
• Олигосахариды
• Отдельные представители дисахаридов
• Лекция 2 строение, свойства, биологическая роль
• Отдельные представители полисахаридов
• Лекция 3 строение, свойства, биологическая роль простых липидов
• Классификация
• Стероиды
• Желчные кислоты
• Лекция 4 строение, свойства, биологическая роль сложных липидов
• Лекция 5 аминокислотный состав белков Белки и их функции
• Функции белков
• Элементарный состав белков
• Методы выделения и очистки белков
• Аминокислотный состав белков
• Химические свойства аминокислот
• Классификация аминокислот, заменимые и незаменимые аминокислоты
• Лекция 6 уровни структурной организации белков Структурная организация белков
• Первичная структура белка: методы исследования. Структурные особенности пептидной связи
• Номенклатура пептидов и полипептидов. Природные пептиды: глутатион, карнозин, ансерин, грамицидин s, окситоцин, энкефалины
• Отдельные представители пептидов
• Вторичная структура белков: -спираль, ее основные характеристики, -структура, -изгиб. Роль водородных связей в формировании вторичной структуры. Сверхвторичные (надвторичные) структуры белка
• Третичная структура белков. Типы нековалентных связей, стабилизирующих третичную структуру. Роль s-s-мостиков в формировании третичной структуры некоторых белков
• Заимодействия между субъединицами, стабилизирующие четвертичную структуру. Функциональное значение четвертичной структуры белков
• Лекция 7
• Физико-химические свойства белков
• Ионизация, гидратация, растворимость,
• Осмотические и онкотические свойства, оптические свойства
• Молекулярная масса и размеры белков. Методы определения молекулярной массы белков. Необходимость применения комплекса методов для точной оценки молекулярной массы белков
• Денатурация белков
• Лекция 8 классификация белков. Простые и сложные белки Принципы классификации белков
• Фибриллярные белки
• Глобулярные белки
• Сложные белки
• Липопротеины
• Гликопротеины
• Протеогликаны
• Фосфопротеины
• Металлопротеины
• Нуклеопротеины
• Хромопротеины
• Гемоглобин
• Миоглобин
• Цитохромы электронтранспортной цепи
• Хлорофиллы
• Флавопротеины
• Лекция 9 сложные белки Гликопротеины
• Фосфопротеины
• Липопротеины
• Металлопротеины
• Лекция 10 строение, свойства, биологическая роль нуклеотидов
• Циклические нуклеотиды
• Лекция 11 строение, свойства, биологическая роль нуклеиновых кислот
• Рибосомальные рнк
• Лекция 12 витамины – биологическая роль, классификация. Водорастворимые витамины
• Витамин в1 (тиамин)
• Витамин в2 (рибофлавин)
• Витамин в3 (рр, никотиновая кислота, никотинамид)
• Витамин в5 (пантотеновая кислота)
• Витамин в6 (пиридоксин, пиридоксаль, пиридоксамин)
• Витамин в9 (фолиевая кислота)
• Витамин в12 (кобалами)
• Витамин н (биотин)
• Витамин с (аскорбиновая кислота)
• Витамин р (рутин)
• Лекция 13 жирорастворимые витамины Витамин а (ретинол)
• Витамин d (кальциферол)
• Витамин е (токоферол)
• Витамин к (нафтохинон)
• Лекция 14
• Ферменты – строение: свойства, механизм действия
• Понятие о ферментах.
• Сущность явлений ферментативного катализа
• Структурная организация ферментов
• 3. Роль металлов в регуляции aктивности ферментов
• Изоферменты: биологическая роль
• Механизм действия ферментов
• Специфичность действия ферментов
• Стационарная кинетика ферментативных реакций
• Концентрация субстрата
• Концентрация фермента
• Температура
• Уравнение Михаэлиса-Ментен
• Единицы ферментов
• Лекция 15
• Ингибиторы ферментов
• Регуляция каталитичекой активности ферментов
• Изостерическая регуляция
• Аллостерический контроль активности ферментов
• Регуляция ферментов ковалентной модификацией
• Регуляция ферментов ограниченным протеолизом (активация зимогенов)
• Регуляция активности мультиэнзимных комплексов
• Классификация и номенклатура ферментов
• Характеристика отдельных классов ферментов
• Ферменты в клинической диагностике. Энзимопатии
• Модуль II. Динамическая биохимия
• Катаболические, анаболические, амфиболические пути
• Метаболизм углеводов
• Расщепление углеводов в пищеварительном тракте
• Переваривание углеводов в ротовой полости
• Переваривание углеводов в кишечнике
• Амилолитические ферменты: характеристика Панкреатическая -амилаза
• Сахаразо-изомальтазный комплекс
• Гликоамилазный комплекс
• Трегалаза
• Всасывание моносахаридов в тонком кишечнике и их дальнейший транспорт. Глюкозные транспортеры
• Всасывание моносахаридов в кишечнике
• Транспорт глюкозы из крови в клетки
• Лекция 17
• Анаэробный катаболизм углеводов
• Анаэробное окисление глюкозы. Гликолиз. Внутриклеточная
• Локализация процесса
• Отдельные реакции гликолиза, их термодинамические характеристики. Образование 2,3-дифосфоглицерата в шунте Рапопорта-Люберинга
• Расщепление гликогена (гликогенолиз). Строение, механизм действия и регуляция гликогенфосфорилазы
• Спиртовое и молочнокислое брожение
• Лекция 18
• Аэробный катаболизм углеводов (часть 1)
• Аэробный метаболизм пирувата. Митохондрии: структура
• И энергетические функции
• Окислительное декарбоксилирование пирувата. Строение
• Цикл лимонной кислоты. Отдельные реакции цикла, их термодинамическая характеристики. Суммарное уравнение окисления ацетил-CоА в цикле Кребса
• Лекция 19
• Аэробный катаболизм углеводов (часть 2)
• Регуляция цикла Кребса на уровне цитратсинтазы,
• Изоцитратдегидрогеназы и -кетоглутаратдегидрогеназного комплекса
• Амфиболическое значение цикла Кребса. Необходимость анаплеротических путей, пополняющих запас компонентов, участвующих в цикле
• Зависимое от атp и биотина карбоксилирование пирувата: анаплеротический путь синтеза оксалоацетата
• Пентозофосфатный путь (гексозомонофосфатный шунт)
• Отдельные реакции пфп, их термодинамические характеристики.
• Суммарное уравнение пентозофосфатного пути.
• Регуляция пентозофосфатного пути на уровне
• Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы
• Участки перекреста пфп с гликолизом
• Циклический характер пфп
• Лекция 20 биосинтез углеводов
• Глюконеогенез
• В последующей реакции, катализируемой ферментом фосфоенолпируваткарбоксикиназой, из оксалоацетата образуется фосфоенолпируват. Реакция Mg2-зависимая и донором фосфата служит gtp.
• Лекция 21 расщепление пищевых и тканевых липидов
• Катаболизм липидов
• Всасывание продуктов расщепления липидов
• Транспорт липидов
• Метаболизм глицерола
• Лекция 22 катаболизм жирных кислот
• Активация жирной кислоты
• Транспорт ацил-СоА в митохондрии
• Катаболизм ненасыщенных жирных кислот
• Катаболизм жирных кислот с нечетным числом атомов углерода
• Образование кетоновых тел (кетогенез)
• Кетоновые тела как источники энергии
• Глиоксилатный цикл
• Лекция 23 биосинтез жирных кислот и триацилглицеролов
• Строение синтазы жирных кислот
• Механизм синтеза жирных кислот
• Транспорт ацетил-СоА из митохондрий в цитозоль
• Образование малонил-СоА
• Наращивание (элонгация) углеродной цепи жирной кислоты
• Синтез других предельных и непредельных жк
• Биосинтез триацилглицеролов
• Лекция 24 биосинтез холестерола и желчных кислот
• Биосинтез холестерола
• Регуляция биосинтеза хс
• Биосинтез желчных кислот
• Лекция 25
• Биологическое окисление. Ферменты, участвующие в биологическом окислении
• Свободное окисление и его биологическая роль. Цитохром р-450
• Микросомальная система окисления
• Механизм гидроксилирования
• Лекция 26
• Цепь переноса электронов и протонов внутренней мембраны
• Митохондрий (дыхательная цепь, редокс-цепь). Компоненты
• Дыхательной цепи: флавопротеины, железосерные белки, коэнзим q, цитохромы в, с1, с, аа3. Топография дыхательных переносчиков
• В редокс-цепи
• Убихинон окисленный CoQ
• Энергетическое значение ступенчатого транспорта электронов от окисляемых субстратов к молекулярному кислороду. Окислительное фосфорилирование в дыхательной цепи
• Организация компонентов дыхательной цепи в виде четырех
• Локализация пунктов сопряжения окисления и фосфорилирования в дыхательной цепи на основании редокс-потенциалов, действия специфических ингибиторов (ротенон, амитал, антимицин а, цианид, со, NaN3)
• Полные и редуцированные дыхательные цепи
• Лекция 27
• Строение атp-синтазного комплекса. Механизм образования атp. Обратимость реакции, катализируемой атp-синтазой. Разобщение транспорта электронов и синтеза атp; действие 2,4-динитрофенола
• Механизм образования атp
• Окисление цитоплазматического nadh в дыхательной цепи. Глицеролфосфатный и малат-аспартатный челночные механизм
• Лекция 28 интеграция клеточного метаболизма
• Основные аспекты регуляции метаболизма
• Регуляция на уровне транскрипции
• Аллостерическая регуляция активности ферментов
• Ковалентная модификация ферментов
• Гормональная регуляция
• Посттранскрипционная и посттрансляционная модификация макромолекул
• Изменение концентрации метаболитов
• Мембранная регуляция
• Модуль III. Молекулярная биология лекция 29 репликация днк
• Точность репликации
• Репликация днк у эукариот
• Репаративный синтез днк
• Лекция 30 транскрипция (биосинтез рнк)
• Транскрипция у прокариот
• Инициация транскрипции
• Элонгация транскрипции
• Терминация транскрипции
• Транскрипция у эукариот
• Механизм индукции на примере Lac-оперона
• Катаболитная репрессия
• Лекция 31 тРансляция (биосинтез белка)
• Роль тРнк в трансляции
• Аминоацил-тРнк-синтетазы
• Белоксинтезирующая система клетки
• Эффективность трансляции
• Точность белкового синтеза
• Энергетические затраты на трансляцию
• Посттрансляционные модификации полипептидной цепи
• Библиографический список Основная литература
• Дополнительная литература