Особенности транскрипции эукариот
Единицей транскрипции у эукариот является отдельный ген, а не оперон, как у прокариот.
Оператор, как таковой, отсутствует.
Промотор есть, но он организован иначе.
На расстоянии -25 п.н. от +1 нукл. находится ТАТА-бокс. Его позиция определяет точку инициации транскрипции. А на расстоянии -60-80 п.н. находится ЦААТ-бокс, который не является абсолютно необходимым, но присутствует перед большинством генов. Расстояние между ЦААТ и ТАТА большое и РНК-полимераза не способна накрыть всю эту область. ЦААТ опознается своим белком, а ТАТА - своим.
|
Помимо этих есть еще несколько белков, называемых базальными факторами транскрипции.
Определение: базальные факторы транскрипции - белки, необходимые для инициации транскрипции.
Базальные факторы транскрипции необходимы для инициации транскрипции всеми тремя ядерными РНК-полимеразами.
Для любого гена, кодирующего белок, есть энхансеры (усилители).
Определение: энхансеры - последовательности ДНК, усиливающие транскрипцию при взаимодействии со специфическими белками.
Энхансеры - это не непрерывные последовательности нуклеотидов. Существуют так называемые модули - это отдельные части энхансеров. Одинаковые модули могут встречаться в разных энхансерах. Для каждого энхансера набор модулей уникален. Модули - это короткие последовательности, не более 2-х витков спирали (20 п.н.), которые могут находиться перед, за и даже внутри гена. |
|
Таким образом, М1+М2+М3+М4 - один энхансер, но он состоит из 4-х модулей. Все 4 модуля узнаются своими белками, а они, сидя на ДНК, взаимодействуют друг с другом. Если в клетке присутствуют все соответствующие белки, то участку ДНК придается определенная конформация и начинается синтез mРНК.
Все соматические клетки многоклеточного эукариотического организма имеют абсолютно одинаковый набор генов. Почему же клетки дифференцированы и специализированы?
Дело в том, что все гены работают на фоновом уровне и не имеют фенотипического проявления. Экспрессируются лишь те гены, у которых все энхансерные модули узнаны своими белками и эти белки взаимодействуют друг с другом. Кроме энхансеров есть сайленсеры (ослабители).
Определение: сайленсеры - последовательности ДНК, ослабляющие транскрипцию при взаимодействии с белками.
При соответствующем наборе белков экспрессия отдельных генов в клетке может быть подавлена.
Процессинг (созревание) rРНК и tРНК у эукариот принципиально не отличается от такового у прокариот.
Процессинг mРНК отличается сильно и состоит из нескольких этапов.
- Определение предмета молекулярная биология
- Основные этапы развития молекулярной биологии
- Основные открытия
- Доказательства генетической роли нуклеиновых кислот
- 1. 1928Г. Опыты Фредерика Гриффита.
- 2. 1952Г. Эксперимент Альфреда Херши и Марты Чейз.
- 3. 1957Г. Опыты Френкеля - Конрата
- Принципы строения днк
- Формы двойной спирали днк
- Отличия между днк и рнк
- Виды рнк
- Функции днк
- 1. Днк является носителем генетической информации. Функция обеспечивается фактом существования генетического кода.
- 2. Воспроизведение и передача генетической информации в поколениях клеток и организмов. Функция обеспечивается процессом репликации.
- 3. Реализация генетической информации в виде белков, а также любых других соединений, образующихся с помощью белков-ферментов. Функция обеспечивается процессами транскрипции и трансляции.
- Аминокислоты
- Классификация аминокислот, входящих в состав белков, по принципу полярности (неполярности) радикала
- Первичная структура белка
- Третичная структура белка
- Четвертичная структура белка
- Серповидно-клеточная анемия, как пример влияния первичной структуры на третичную и четвертичную.
- Глобулярные и фибриллярные белки.
- 95% Белков имеют гидрофобное ядро.
- 5% Фибриллярные белки.
- Функции белков
- Свойства генетического кода
- 1. Триплетность
- 2. Вырожденность.
- 3. Наличие межгенных знаков препинания.
- 4. Однозначность.
- 5. Компактность, или отсутствие внутригенных знаков препинания.
- 6. Универсальность.
- Принципы транскрипции:
- Субъединичный состав рнк-полимеразы е.Coli
- Особенности структуры промотора
- Этапы транскрипции
- 1. Узнавание и прочное связывание
- 2. Инициация заключается в образовании первой фосфодиэфирной связи между пурин-трифосфатом (атф или гтф) и следующим нуклеотидом. После инициации - фактор покидает фермент.
- 3. Элонгация - последовательное наращивание цепи рнк (или продолжение транскрипции).
- 4. Терминация.
- Позитивный контроль работы lac-оперона
- Структура транспортной рнк
- Рекогниция
- 1. Активирование аминокислоты.
- 2. Присоединение аминокислоты к tРнк - аминоацилирование.
- Структура рибосом
- Каталитические центры рибосом
- Синтез полипептидов на рибосоме
- Регуляция образования рибосомных рнк и белков рибосом e.Сoli
- 73 Гена должны работать координированно, чтобы не было избытка белков или rРнк.
- Транскрипция у эукариот
- Как образуются рибосомы у эукариот
- Особенности транскрипции эукариот
- 1. Кепирование 100% mРнк
- 4.Редактирование Показано лишь для нескольких mРнк.
- Кепирование
- Назначение "Сар"
- 1. Защита 5'-конца mРнк от действия экзонуклеаз.
- 2. За счет узнавания "Сар"-связывающими белками происходит правильная установка mРнк на рибосоме. Полиаденилирование
- Сплайсинг
- Альтернативный сплайсинг mРнк кальцитонинового гена у млекопитающих (крыса)
- Автосплайсинг
- Малые рнк
- Репликация днк
- Принципы репликации
- Доказательство полуконсервативного характера репликации
- Понятие о матрице и затравке
- 1960Г. Гипотетическая модель.
- Сравнительные характеристики днк-полимераз e. Сoli
- 1974 Г. Оказаки.
- Топологические проблемы репликации днк
- Геликазы
- Топоизомеразы
- Проблема репликации концов линейных молекул
- Причины ошибок при синтезе днк
- In vitro происходит 1 ошибка на 100 тыс. Нукл. Для средней днк-полимеразы.
- In vitro можно уменьшить вероятность ошибки до 1 на 1млн. Нукл., если добавить ssb, геликазу и лигазу.
- Этапы проверки
- Вероятность ошибок для ферментов вирусов, про- и эукариот
- Основные репарабельные повреждения в днк и принципы их устранения
- 1. Апуринизация.
- 2. Дезаминирование.
- 3. Тиминовые димеры.
- Размер генома
- "Избыточность" эукариотического генома
- 1. Большой размер генов (за счет наличия интронов).
- 2. Присутствие повторенных последовательностей. Повторяются и гены, и некодирующие участки. У эукариот некоторые последовательности повторены сотни и тысячи раз.
- Общая характеристика гистонов
- Четыре уровня компактизации днк
- 1. Нуклеосомный.
- 2. Супербидный, или соленоидный.
- 3. Петлевой уровень.
- 4. Метафазная хромосома.
- Основы метода ренатурации днк
- Быстрые повторы
- 3. Сателлитная днк всегда располагается тандемно по 100-200 единиц в блоке. Образуются длинные последовательности в геноме.
- 4. У недавно образовавшихся на одной территории близких видов сателлитная днк заведомо разная.
- Умеренные повторы
- Уникальные гены
- Другая классификация генов
- Умеренные фаги
- Эффекты, вызываемые мобильными элементами
- Молекулярные основы канцерогенеза
- Теории рака
- Обратная транскрипция
- Гипотезы возникновения жизни
- Теория биопоэза
- 1. Образование биомономеров.
- 2. Образование биополимеров и их эволюция. Образование систем с обратной связью.
- 3. Образование мембранных структур и пробионтов (первых клеток).
- 2 Стадия биопоэза.
- Стадия 3.
- Эволюция пробиотов