058567_235D1_lekcii_molekulyarnaya_biologiya
Третичная структура белка
Определение: третичная структура белка - это пространственная конформация полипептида, имеющего вторичную структуру, и обусловленная взаимодействиями между радикалами.
Существует четыре типа взаимодействий между радикалами:
1. Ковалентные связи между остатками двух цистеинов(дисульфидные мостики). |
|
2. Ионные (электростатические) взаимодействия между противоположно заряженными аминокислотными остатками (три радикала со знаком "+" и два со знаком "-"). Например, положительно заряженная ε-аминогруппа лизина (-NH3+ ) притягивается отрицательно заряженной карбоксильной группой - (СОО-) глутаминовой или аспарагиновой кислоты. | |
3. Водородные связи. Участвуют все аминокислоты, имеющие гидроксильные, амидные или карбоксильные группы. | |
4. Гидрофобные взаимодействия . Образуются между неполярными радикалами в водной среде. Участвуют 8 аминокислот (первый класс).
| |
Третичная структура полностью задается первичной.
Определяющими являются гидрофобные взаимодействия в силу неизбирательности (неспецифичности) и многочисленности.
Гидрофобное ядро существует у большинства белков.
Содержание
- Определение предмета молекулярная биология
- Основные этапы развития молекулярной биологии
- Основные открытия
- Доказательства генетической роли нуклеиновых кислот
- 1. 1928Г. Опыты Фредерика Гриффита.
- 2. 1952Г. Эксперимент Альфреда Херши и Марты Чейз.
- 3. 1957Г. Опыты Френкеля - Конрата
- Принципы строения днк
- Формы двойной спирали днк
- Отличия между днк и рнк
- Виды рнк
- Функции днк
- 1. Днк является носителем генетической информации. Функция обеспечивается фактом существования генетического кода.
- 2. Воспроизведение и передача генетической информации в поколениях клеток и организмов. Функция обеспечивается процессом репликации.
- 3. Реализация генетической информации в виде белков, а также любых других соединений, образующихся с помощью белков-ферментов. Функция обеспечивается процессами транскрипции и трансляции.
- Аминокислоты
- Классификация аминокислот, входящих в состав белков, по принципу полярности (неполярности) радикала
- Первичная структура белка
- Третичная структура белка
- Четвертичная структура белка
- Серповидно-клеточная анемия, как пример влияния первичной структуры на третичную и четвертичную.
- Глобулярные и фибриллярные белки.
- 95% Белков имеют гидрофобное ядро.
- 5% Фибриллярные белки.
- Функции белков
- Свойства генетического кода
- 1. Триплетность
- 2. Вырожденность.
- 3. Наличие межгенных знаков препинания.
- 4. Однозначность.
- 5. Компактность, или отсутствие внутригенных знаков препинания.
- 6. Универсальность.
- Принципы транскрипции:
- Субъединичный состав рнк-полимеразы е.Coli
- Особенности структуры промотора
- Этапы транскрипции
- 1. Узнавание и прочное связывание
- 2. Инициация заключается в образовании первой фосфодиэфирной связи между пурин-трифосфатом (атф или гтф) и следующим нуклеотидом. После инициации - фактор покидает фермент.
- 3. Элонгация - последовательное наращивание цепи рнк (или продолжение транскрипции).
- 4. Терминация.
- Позитивный контроль работы lac-оперона
- Структура транспортной рнк
- Рекогниция
- 1. Активирование аминокислоты.
- 2. Присоединение аминокислоты к tРнк - аминоацилирование.
- Структура рибосом
- Каталитические центры рибосом
- Синтез полипептидов на рибосоме
- Регуляция образования рибосомных рнк и белков рибосом e.Сoli
- 73 Гена должны работать координированно, чтобы не было избытка белков или rРнк.
- Транскрипция у эукариот
- Как образуются рибосомы у эукариот
- Особенности транскрипции эукариот
- 1. Кепирование 100% mРнк
- 4.Редактирование Показано лишь для нескольких mРнк.
- Кепирование
- Назначение "Сар"
- 1. Защита 5'-конца mРнк от действия экзонуклеаз.
- 2. За счет узнавания "Сар"-связывающими белками происходит правильная установка mРнк на рибосоме. Полиаденилирование
- Сплайсинг
- Альтернативный сплайсинг mРнк кальцитонинового гена у млекопитающих (крыса)
- Автосплайсинг
- Малые рнк
- Репликация днк
- Принципы репликации
- Доказательство полуконсервативного характера репликации
- Понятие о матрице и затравке
- 1960Г. Гипотетическая модель.
- Сравнительные характеристики днк-полимераз e. Сoli
- 1974 Г. Оказаки.
- Топологические проблемы репликации днк
- Геликазы
- Топоизомеразы
- Проблема репликации концов линейных молекул
- Причины ошибок при синтезе днк
- In vitro происходит 1 ошибка на 100 тыс. Нукл. Для средней днк-полимеразы.
- In vitro можно уменьшить вероятность ошибки до 1 на 1млн. Нукл., если добавить ssb, геликазу и лигазу.
- Этапы проверки
- Вероятность ошибок для ферментов вирусов, про- и эукариот
- Основные репарабельные повреждения в днк и принципы их устранения
- 1. Апуринизация.
- 2. Дезаминирование.
- 3. Тиминовые димеры.
- Размер генома
- "Избыточность" эукариотического генома
- 1. Большой размер генов (за счет наличия интронов).
- 2. Присутствие повторенных последовательностей. Повторяются и гены, и некодирующие участки. У эукариот некоторые последовательности повторены сотни и тысячи раз.
- Общая характеристика гистонов
- Четыре уровня компактизации днк
- 1. Нуклеосомный.
- 2. Супербидный, или соленоидный.
- 3. Петлевой уровень.
- 4. Метафазная хромосома.
- Основы метода ренатурации днк
- Быстрые повторы
- 3. Сателлитная днк всегда располагается тандемно по 100-200 единиц в блоке. Образуются длинные последовательности в геноме.
- 4. У недавно образовавшихся на одной территории близких видов сателлитная днк заведомо разная.
- Умеренные повторы
- Уникальные гены
- Другая классификация генов
- Умеренные фаги
- Эффекты, вызываемые мобильными элементами
- Молекулярные основы канцерогенеза
- Теории рака
- Обратная транскрипция
- Гипотезы возникновения жизни
- Теория биопоэза
- 1. Образование биомономеров.
- 2. Образование биополимеров и их эволюция. Образование систем с обратной связью.
- 3. Образование мембранных структур и пробионтов (первых клеток).
- 2 Стадия биопоэза.
- Стадия 3.
- Эволюция пробиотов